feat(commands,bash): estandarizar todos los apps y analyses como dataforge/<name>

- /full-git-push y /full-git-pull descubren apps/analyses sin .git y los
  inicializan/clonan automaticamente contra dataforge/<basename>.
- ensure_repo_synced.sh: localizar gitea_create_repo.sh / gitea_push_directory.sh
  via FN_REGISTRY_INFRA_DIR o FN_REGISTRY_ROOT (mas robusto al sourcing
  desde directorios arbitrarios y desde zsh).

Co-Authored-By: Claude Opus 4.7 (1M context) <noreply@anthropic.com>

.claude/commands/full-git-pull.md

@@ -8,10 +8,11 @@ Trae los últimos cambios del remote para el repo principal `fn_registry`, todos
 
 ## Pasos
 
-### 1. Descubrir repos
+### 1. Descubrir repos + clonar dataforge/<name> faltantes
 
 ```bash
-cd /home/egutierrez/fn_registry
+cd /home/lucas/fn_registry  # ajustar al PC
+
 REPOS=$(find . -name ".git" -type d \
   -not -path "./.git/*" \
   -not -path "*/node_modules/*" \
@@ -19,10 +20,25 @@ REPOS=$(find . -name ".git" -type d \
   -not -path "*/cpp/vendor/*" \
   -not -path "*/cpp/build/*" \
   -not -path "*/sources/*" \
-  -not -path "*/temp/*" 2>/dev/null | sed 's|/.git$||')
+  -not -path "*/temp/*" \
+  -not -path "*/subrepos/*" 2>/dev/null | sed 's|/.git$||')
 REPOS=". $REPOS"
 ```
 
+Despues, despues de `fn sync` (paso 5), hacer **una segunda pasada** para clonar repos `dataforge/<name>` que esten registrados en `pc_locations` o `apps`/`analysis` pero no existan localmente — la metadata vino del API y los repos hay que clonarlos:
+
+```bash
+# Listar apps + analysis registradas con dir_path
+sqlite3 registry.db "SELECT name, dir_path FROM apps WHERE dir_path != '' UNION SELECT name, dir_path FROM analysis WHERE dir_path != '';" | while IFS='|' read name path; do
+  full="$path"
+  if [[ ! -d "$full/.git" && ! -d "$full" ]]; then
+    GITEA_URL=$(pass agentes/gitea-url | head -n1)
+    GITEA_TOKEN=$(pass gitea/dataforge-git-token | head -n1)
+    git clone "https://${GITEA_TOKEN}@${GITEA_URL#https://}/dataforge/${name}.git" "$full" 2>&1 | tail -2
+  fi
+done
+```
+
 ### 2. Para cada repo: stash si dirty, pull --ff-only, pop
 
 ```bash