`registry.db` SOLO existe en la raiz del repositorio, NUNCA en subdirectorios ni apps.

`operations.db` SOLO existe dentro de cada app (`apps/*/operations.db`), NUNCA en la raiz. Cada app tiene su propia operations.db con sus entities, relations y executions independientes.

Si se detecta un registry.db fuera de la raiz o un operations.db en la raiz, es un error y debe eliminarse.