# eda — Exploratory Data Analysis por tabla y base Grupo de capacidad para perfilar tablas y bases de datos completas y entender datasets nuevos rápido, repetible y sin reinventar lógica. Motor **DuckDB SQL push-down**: los agregados (`SUMMARIZE`, `COUNT DISTINCT`, `corr()`, percentiles) se calculan en SQL sin traer las filas a RAM; solo una muestra pequeña baja a Python para lo estadístico fino (skew, kurtosis, histograma, correlación mixta, modelos). Orquestadores one-shot: - `profile_table_py_pipelines` — "hazme un EDA de esta tabla" → `TableProfile` completo + report markdown + JSON (+ PDF móvil con `emit_pdf`). Flags `run_models` (modelos baratos), `run_llm` (interpretación LLM), `run_series` (análisis de serie temporal por columna numérica) y `emit_pdf` (PDF vertical legible en móvil). Re-expresión sugerida por columna y avisos exploratorios se añaden siempre. - `profile_database_py_pipelines` — "hazme un EDA de esta base" → perfila todas las tablas + infiere FK + join graph (mermaid). > Cuando Enmanuel pide un EDA, el flujo acordado es: perfilar con este grupo, escribir el report, y **generar un analysis Jupyter lanzado en el navegador colaborativo y ejecutado por Claude** para verlo en vivo. Ver la memoria `eda-workflow-registry` y la regla `notebook_collaboration.md`. ## Funciones ### Perfilado base (tabla y columna) | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `summarize_table_duckdb_py_datascience` | impure | Corazón (DuckDB): `SUMMARIZE` push-down + `COUNT DISTINCT` exacto (≤200k filas) → esqueleto del `TableProfile`. | | `summarize_table_pg_py_datascience` | impure | Adaptador PostgreSQL: mismo esqueleto `TableProfile` vía SQL push-down (information_schema + count/distinct/min/max/avg/stddev/percentile_cont). | | `describe_numeric_py_datascience` | pure | Bloque numérico: min/max/mean/median/std/cv, p1-p99, IQR, skew, kurtosis, outliers, distribución, histograma. | | `summarize_categorical_py_datascience` | pure | top-k frecuencias, mode, distinct, entropía, imbalance, longitudes. | | `infer_semantic_type_py_datascience` | pure | Tipo semántico por regex (email/url/ip/uuid/iban/currency/datetime/...). | | `column_quality_score_py_datascience` | pure | Score 0-100 (completeness/validity/consistency) + issues. | | `render_eda_markdown_py_datascience` | pure | `TableProfile` → report markdown con sparklines ASCII. | | `summary_stats_py_datascience` | pure | Descriptiva mínima (n, mean, median, p25, p75). | ### Correlación / asociación | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `pearson_py_datascience` | pure | Correlación lineal num↔num (preexistente). | | `spearman_corr_py_datascience` | pure | Correlación de rangos (monotónica no lineal) num↔num. | | `cramers_v_py_datascience` | pure | Asociación simétrica cat↔cat (corrección Bergsma-Wicher). | | `theils_u_py_datascience` | pure | Asociación direccional U(a\|b) cat↔cat. | | `correlation_ratio_py_datascience` | pure | η: cuánto explica una categórica a una numérica. | | `mutual_info_columns_py_datascience` | pure | Información mutua (no lineal, general) entre cualquier par. | | `association_matrix_py_datascience` | pure | Matriz unificada: elige métrica por par de tipos + pares fuertes. | | `correlation_matrix_duckdb_py_datascience` | impure | Matriz Pearson push-down (`corr()` SQL) para muchas filas. | ### Relaciones inter-tabla | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `infer_fk_containment_duckdb_py_datascience` | impure | Infiere FK candidatas por containment de valores (inclusion coefficient). | | `build_join_graph_py_datascience` | pure | FK candidates → grafo (roles fact/dimension) + diagrama Mermaid. | ### Modelos baratos (flag `run_models`) | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `pca_explained_py_datascience` | pure | PCA: varianza explicada + loadings + proyección. | | `kmeans_segments_py_datascience` | pure | Segmentos naturales, auto-k por silhouette. | | `isolation_forest_outliers_py_datascience` | pure | Outliers multivariante (filas anómalas). | | `normality_tests_py_datascience` | pure | Jarque-Bera + D'Agostino + Shapiro → ¿normal? | | `trend_slope_py_datascience` | pure | Tendencia de una serie (up/down/flat) por regresión lineal. | | `run_eda_models_py_datascience` | pure | Wrapper: compone PCA + KMeans + IsolationForest + normalidad → bloque `models`. | ### Series temporales (flag `run_series`) | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `adf_kpss_stationarity_py_datascience` | pure | Estacionariedad por consenso ADF + KPSS (hipótesis nulas opuestas) → veredicto `stationary`/`non_stationary`/`inconclusive` + aviso de correlación espuria. | | `acf_pacf_py_datascience` | pure | ACF + PACF con bandas de confianza + lags significativos + Ljung-Box (¿ruido blanco?). Detecta autocorrelación que infla los p-valores OLS. | | `stl_decompose_py_datascience` | pure | Descomposición STL (tendencia/estacional/resto) + fuerza de tendencia y estacional de Hyndman. Auto-infiere el periodo por autocorrelación. | | `to_returns_py_datascience` | pure | Convierte una serie de niveles (precios) a retornos log/simples. Los niveles no son estacionarios; los retornos sí (unidad correcta para correlacionar/modelar). | ### Rigor y disciplina exploratoria | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `fdr_correction_py_datascience` | pure | Corrige p-valores por comparaciones múltiples (Benjamini-Hochberg FDR / Bonferroni FWER) → controla el data-mining bias. Ya integrada en `association_matrix`. | | `suggest_reexpression_py_datascience` | pure | Escalera de potencias de Tukey: qué transformación (log/sqrt/Yeo-Johnson/...) simetriza mejor una columna numérica según su skew y dominio. No la ejecuta, la sugiere. | | `exploratory_caveats_py_datascience` | pure | Genera las advertencias de que el EDA es exploratorio (correlación≠causalidad, overfitting in-sample, comparaciones múltiples, outliers, muestra pequeña, MNAR) según lo que el perfil realmente contiene. | ### Capa LLM y entrega | ID | Pureza | Qué hace | |---|---|---| | `eda_llm_insights_py_datascience` | impure | 1 call LLM sobre el perfil agregado (no filas crudas): data dictionary, resumen, granularidad de fila, PII/RGPD, limpieza, análisis sugeridos. | | `build_eda_notebook_py_datascience` | impure | Genera un `.ipynb` (nbformat v4) que perfila la tabla, listo para lanzar en Jupyter colaborativo. | | `render_eda_pdf_py_datascience` | impure | Renderiza el `TableProfile` a un PDF multipágina **vertical (A5), legible en móvil** (estilo Tufte: histogramas como small multiples, top-k, heatmap de asociación). 4ª salida del workflow, junto a JSON/Markdown/notebook. | ### Orquestadores (pipelines) | ID | Qué hace | |---|---| | `profile_table_py_pipelines` | EDA de una tabla end-to-end, `backend="duckdb"` (default) o `"postgres"` (base + correlación con FDR + `run_models` + `run_llm` + `run_series` + re-expresión + caveats) → JSON + markdown (+ PDF móvil con `emit_pdf`). | | `profile_database_py_pipelines` | EDA de una base entera: todas las tablas + FK + join graph. | ## Contrato de datos ``` TableProfile = {table, source, profiled_at, n_rows, n_cols, size_bytes, duplicate_rows, duplicate_pct, constant_cols, all_null_cols, null_cell_pct, type_breakdown:{numeric,categorical,datetime,text,boolean}, columns:[ColumnProfile], correlations, key_candidates, quality_score, llm, models, series:{:SeriesBlock}|None, # solo con run_series caveats:{n, caveats:[{id,topic,message,reference}], note}} # siempre ColumnProfile = {name, physical_type, inferred_type, semantic_type, count, n_rows, null_count, null_pct, empty_count, empty_pct, distinct_count, unique_pct, flags:[constant|possible_id|high_cardinality|mostly_null], quality_score, numeric:{...}|None, categorical:{...}|None, datetime:{...}|None, reexpression:{recommended,ladder_power,reason,alternatives,skew}|None, # cols numéricas series:SeriesBlock|None} # solo con run_series # *_pct son FRACCIONES 0-1; el render las muestra ×100 SeriesBlock = {order_col, ordered, n, stationarity:{adf,kpss,verdict,warning}, acf_pacf:{acf,pacf,significant_acf_lags,ljung_box,is_autocorrelated}, stl:{period,trend_strength,seasonal_strength,...}, to_returns:{...}|absent, levels_suggested:bool} correlations = {pairs:[{a,b,a_type,b_type,method,value,extra,p_value, p_value_adjusted,significant}], strong:[...], methods_legend, multiple_testing:{method,alpha,n_tests,n_rejected}} # p-valores corregidos por FDR models = {n_numeric_cols, pca, kmeans, outliers, normality, note} llm = {summary, row_meaning, dictionary:[{column,description,business_meaning,unit}], pii:[{column,kind,severity}], cleaning:[str], analyses:[str]} ``` ## Ejemplo canónico EDA completo de una tabla (estadística + correlación + modelos + LLM + report): ```python import sys, os sys.path.insert(0, os.path.join("python", "functions")) from pipelines.profile_table import profile_table r = profile_table( "/ruta/datos.duckdb", "clientes", run_models=True, run_llm=True, run_series=True, emit_pdf=True, ) prof = r["profile"] print(r["report_md_path"]) # reports/eda_clientes_.md print(r["pdf_path"]) # reports/eda_clientes_.pdf (móvil) print(prof["correlations"]["strong"]) # pares fuertes Y significativos tras FDR print(prof["models"]["kmeans"]["best_k"]) # segmentos print(prof["series"]["precio"]["stationarity"]["verdict"]) # ¿serie estacionaria? print(prof["columns"][0]["reexpression"]["recommended"]) # transformación sugerida print(prof["caveats"]["caveats"][0]["message"]) # aviso exploratorio general print(prof["llm"]["row_meaning"]) # qué representa 1 fila ``` EDA de una base entera con relaciones: ```python from pipelines.profile_database import profile_database r = profile_database("/ruta/datos.duckdb") # todas las tablas print(r["db_profile"]["join_graph"]["mermaid"]) # diagrama de relaciones FK ``` Notebook ejecutable: ```python from datascience import build_eda_notebook build_eda_notebook("/ruta/datos.duckdb", "clientes", "/tmp/eda.ipynb", run_models=True) ``` ## Fronteras - **NO carga la tabla entera a RAM**: metadata SQL + muestra por columna/filas (`sample`, default 5000). - **Distinct exacto hasta 200k filas**; por encima aproximado capado. - **Correlación de tabla** se calcula sobre la muestra de filas alineadas; excluye columnas id-like (alta cardinalidad) para evitar asociación espuria. `correlation_matrix_duckdb` ofrece Pearson push-down exacto a escala si hace falta. - **Modelos** (`run_models`) requieren ≥2 columnas numéricas para PCA/KMeans/IsolationForest; normalidad funciona con 1. - **LLM** (`run_llm`) hace 1 llamada (haiku) y envía solo el perfil agregado, nunca filas crudas; requiere token OAuth de Claude. - **Series** (`run_series`) trata cada columna numérica como serie temporal: si hay una columna datetime se ordena por ella, si no por el orden físico de filas. Necesita ≥8 puntos válidos por columna; STL exige ≥2 periodos. La sugerencia de retornos (`to_returns`) solo aparece en columnas estrictamente positivas y no claramente estacionarias (series de niveles/precios). - **PDF** (`emit_pdf`) genera un PDF A5 vertical legible en móvil junto al report markdown vía `render_eda_pdf` (matplotlib `PdfPages`, sin dependencias nuevas). - **Correlaciones**: los p-valores de cada par se corrigen por comparaciones múltiples (FDR Benjamini-Hochberg) dentro de `association_matrix`; un par solo entra en `strong` si supera el umbral de magnitud Y es significativo tras la corrección. - **Fuentes**: DuckDB nativo (CSV/Parquet/Excel cargándolos antes a DuckDB) y **PostgreSQL** (`backend="postgres"`, DSN vía `resolve_pg_dsn`). BigQuery pendiente. `profile_database` (multi-tabla + FK) es solo DuckDB por ahora. ## Estado Implementado y validado end-to-end (152 tests verdes): perfilado base, correlación/asociación (Pearson/Spearman/Cramér's V/Theil's U/η/MI), relaciones inter-tabla (FK + join graph), modelos baratos (PCA/KMeans/IsolationForest/normalidad/tendencia), capa LLM y generación de notebook. Validado sobre PostgreSQL real (tablas del Metabase local del proyecto captacion_clientes). Pendiente: adaptador BigQuery; `profile_database` multi-tabla para PostgreSQL (hoy solo DuckDB); perfil fino de columnas datetime (`profile_datetime`); excluir columnas numéricas `possible_id` de la matriz de asociación (hoy solo se excluyen las categóricas id-like).