fn_registry/.claude/rules/apps_subrepo.md

Apps son sub-repos Gitea independientes — gotcha al usar worktrees

Regla operativa critica descubierta el 2026-05-18 durante implementacion del flow 0008.

El gotcha

apps/*/ esta en .gitignore del repo fn_registry. Cada app es su propio repo Gitea en dataforge/<app_name> con su .git/ dentro de apps/<app_name>/. Esto significa:

• Cuando un agente trabaja en un git worktree del repo padre y crea apps/<nueva_app>/, los archivos viven SOLO en el working directory del worktree.
• Como apps/*/ esta gitignored en el repo padre, los archivos no se pueden commitear al worktree del repo padre.
• Cuando se hace git worktree remove --force worktrees/<slug>/, el working directory entero se borra — el codigo de la app desaparece.

Consecuencia: una app creada dentro de un worktree del repo padre se pierde al limpiar el worktree salvo que se haya promovido a su propio sub-repo Gitea ANTES.

El patron correcto al crear apps en worktrees

# 1. Agente trabaja en worktree del repo padre
cd $HOME/fn_registry/worktrees/<slug>

# 2. Scaffold la app via pipeline canonico
./fn run init_cpp_app <name>           # apps C++
# o ./fn run init_jupyter_analysis ... # analysis
# o crear apps/<name>/ a mano (Go service, etc.)

# 3. ANTES de salir del worktree: inicializa la app como sub-repo
cd apps/<name>
git init -b master
git add -A
git -c user.email="agent@fn_registry" -c user.name="agent" \
    commit -m "feat: initial scaffold of <name>"

# 4. Trabajo continua en sub-repo (commits dentro de apps/<name>/.git)
# 5. Cerrar issue en repo padre (mv .md a completed/), commit del padre con cambios en cpp/CMakeLists.txt, etc.

Cuando el humano corre /full-git-push despues del merge, el script ensure_repo_synced_bash_infra detecta que apps/<name>/.git existe + no tiene remote + crea repo Gitea en dataforge/<name> + pushea master.

Que ESTA SI versionado en el repo padre

• cpp/CMakeLists.txt (el if(EXISTS ...) add_subdirectory(apps/<name>) endif()).
• dev/issues/completed/<NNNN>-<slug>.md (cierre del issue).
• docs/capabilities/*.md si la app aporta a un capability group.
• dev/feature_flags.json si introduce flags.

Todo lo demas (codigo de la app + app.md + appicon + service unit + tests propios de la app) vive en apps/<name>/.git independiente.

Sintomas de la perdida

Si limpias el worktree y luego corres ls apps/<name>/, devuelve "No such file or directory" pese a que el issue aparece cerrado en dev/issues/completed/. Patron = scaffold sin sub-repo init = trabajo perdido.

Recovery si pasa

1. Re-crear worktree desde master.
2. Re-spawn agente con instruccion explicita: git init dentro de la app antes de terminar.
3. NO eliminar el worktree hasta confirmar que apps/<name>/.git esta inicializado con al menos un commit.

Aplica tambien a analysis

analysis/*/ y projects/*/analysis/*/ siguen mismo patron (cada analysis es repo Gitea). El pipeline init_jupyter_analysis_bash_pipelines ya hace git init automatico — por eso no hubo perdidas alli. Las apps C++/Go scaffolded a mano NO inicializan el sub-repo automaticamente — es responsabilidad del agente.

Lo que aprende parallel-fix-issues

El template del prompt de cada agente DEBE incluir la instruccion:

"Si tu issue crea una app nueva en apps/<name>/, inicializa el sub-repo (cd apps/<name> && git init -b master && git add -A && git commit ...) antes de terminar. Sin esto, apps/* esta gitignored y el codigo se perdera cuando el orquestador limpie el worktree."

Aplicar este parrafo al template del skill — ver .claude/skills/parallel-fix-issues/SKILL.md (o equivalente).

Relacion con otras reglas

• apps_tbd — TBD en apps, esta regla complementa con el patron de sub-repo init.
• artefactos — apps son artefactos, esta regla especifica gotcha de su sub-repo.
• apps_vs_functions — apps en apps/, esta regla refuerza por que apps/* gitignored.