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1 Commits
| Author | SHA1 | Date | |
|---|---|---|---|
| 48de3ce3da |
@@ -64,6 +64,7 @@ from .exploratory_caveats import exploratory_caveats
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from .render_eda_pdf import render_eda_pdf, render_eda_pdf_relational
|
||||
from .render_automatic_eda_pdf import render_automatic_eda_pdf
|
||||
from .render_automatic_eda_pptx import render_automatic_eda_pptx
|
||||
from .render_automatic_eda_markdown import render_automatic_eda_markdown
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||||
from .detect_time_column import detect_time_column
|
||||
from .extract_timeseries_raw import extract_timeseries_raw
|
||||
from .build_eda_render_ctx import build_eda_render_ctx
|
||||
@@ -82,6 +83,7 @@ __all__ = [
|
||||
"resample_timeseries",
|
||||
"render_automatic_eda_pdf",
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||||
"render_automatic_eda_pptx",
|
||||
"render_automatic_eda_markdown",
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"decode_qr_image",
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||||
"adf_kpss_stationarity",
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||||
"acf_pacf",
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@@ -36,6 +36,7 @@ from .model import ( # noqa: F401
|
||||
from .chapters_registry import CHAPTER_ORDER, build_chapter, build_document # noqa: F401
|
||||
from .render_pdf_impl import render_pdf # noqa: F401
|
||||
from .render_pptx_impl import render_pptx # noqa: F401
|
||||
from .render_md_impl import render_md # noqa: F401
|
||||
|
||||
__all__ = [
|
||||
"ENGINE_NAME",
|
||||
@@ -60,4 +61,5 @@ __all__ = [
|
||||
"build_document",
|
||||
"render_pdf",
|
||||
"render_pptx",
|
||||
"render_md",
|
||||
]
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||||
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||||
@@ -561,11 +561,13 @@ def _intro_blocks(gloss=None, mark_term: bool = False) -> list:
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||||
t_groupby = _term(mark_term, "groupby", "**por grupos** (split-apply-combine)")
|
||||
t_pivot = _term(mark_term, "pivot_table", "**tablas dinámicas** (pivot)")
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||||
text = (
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f"Este capítulo analiza la tabla {t_groupby}: elige las columnas "
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||||
"categóricas más informativas (por cardinalidad y relevancia, no todas "
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||||
"contra todas) y resume las variables numéricas dentro de cada grupo "
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||||
f"(conteo, media, mediana, desviación). Se añaden {t_pivot} y "
|
||||
"**gráficos de barras** (siempre desde cero) para comparar los grupos."
|
||||
f"Este capítulo analiza la tabla {t_groupby}: "
|
||||
"elige las columnas categóricas más informativas — por su cardinalidad "
|
||||
"y relevancia, no todas contra todas, para no inflar comparaciones "
|
||||
"espurias — y resume las variables numéricas dentro de cada grupo "
|
||||
f"(conteo, media, mediana, desviación). Las {t_pivot} "
|
||||
"cruzan dos categóricas sobre una medida, y los **gráficos de barras** "
|
||||
"(siempre desde cero) comparan los grupos de un vistazo."
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||||
)
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||||
return [model.Heading(text=CHAPTER_TITLE, level=1),
|
||||
model.Markdown(text=text)]
|
||||
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||||
@@ -3,13 +3,12 @@
|
||||
Builds the quality chapter from a ``TableProfile`` of the ``eda`` group. The
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||||
chapter implements the quality model of report 2046:
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||||
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1. **En qué se basa la calidad** — a concise intro naming the two scored
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||||
1. **En qué se basa la calidad** — an intro paragraph explaining the two scored
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dimensions and their weights (completitud 60%, validez 40%) plus the
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table-level row uniqueness, BEFORE any number, and stating that outliers are
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reported as observations and do **not** lower the score. The criteria terms
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(calidad de datos, completitud, validez, unicidad de registro) are hooked
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into the shared glossary as clickable jumps; their full definitions live in
|
||||
the GLOSARIO chapter, not inline here.
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||||
table-level row uniqueness, BEFORE any number, and stating explicitly that
|
||||
outliers are reported as observations and do **not** lower the score. The
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criteria terms (calidad de datos, completitud, validez, unicidad de registro)
|
||||
are hooked into the shared glossary as clickable jumps.
|
||||
2. **Scores por columna** — a table with, per column, the total quality score and
|
||||
its breakdown into completeness / validity (no consistency dimension).
|
||||
3. **Problemas de calidad** — a table listing ONLY real quality defects
|
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@@ -310,22 +309,30 @@ def _term(key: str, label: str, mark: bool) -> str:
|
||||
|
||||
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||||
def _criteria_intro(mark: bool) -> str:
|
||||
"""Intro: how the score is composed, with every term marked clickable.
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||||
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||||
Concise on purpose: the definitions of each term (calidad de datos,
|
||||
completitud, validez, unicidad de registro) now live in the GLOSARIO
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chapter, so the body no longer repeats them — it only states how the score
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||||
is composed and keeps each term marked so it stays a clickable jump.
|
||||
"""
|
||||
"""Intro paragraph explaining the two scored dimensions and the principle."""
|
||||
calidad = _term("calidad_datos", "calidad de datos", mark)
|
||||
completitud = _term("completitud", "completitud", mark)
|
||||
validez = _term("validez", "validez", mark)
|
||||
completitud = _term("completitud", "Completitud (peso 60%)", mark)
|
||||
validez = _term("validez", "Validez (peso 40%, cuando es medible)", mark)
|
||||
unicidad = _term("unicidad_registro", "unicidad de registro", mark)
|
||||
return (
|
||||
f"La {calidad} de cada columna es un score de 0 a 100 que combina "
|
||||
f"{completitud} (peso 60%) y {validez} (peso 40%, cuando es medible); "
|
||||
f"a nivel de tabla se añade la {unicidad}. Los valores atípicos no "
|
||||
"bajan el score: se listan aparte como **observaciones analíticas**."
|
||||
f"La {calidad} de cada columna es un score de 0 a 100 que combina solo "
|
||||
"dimensiones medibles desde el perfil de la tabla, sin fuente externa "
|
||||
"de verdad:\n\n"
|
||||
f"- {completitud}: proporción de valores presentes (1 − % de nulos; en "
|
||||
"texto, las celdas vacías cuentan como faltantes). Los nulos y vacíos "
|
||||
"bajan el score.\n"
|
||||
f"- {validez}: proporción de valores que encajan con su tipo o formato "
|
||||
"(un número que parsea, una fecha legible, un email con forma de email). "
|
||||
"Si una columna es texto libre sin formato esperado, la validez no se "
|
||||
"mide y el score se basa solo en la completitud.\n\n"
|
||||
f"Score de columna = 100 × (0,6·completitud + 0,4·validez), "
|
||||
"renormalizado cuando la validez no aplica. A nivel de tabla se añade "
|
||||
f"la {unicidad} (1 − % de filas duplicadas).\n\n"
|
||||
"**Los valores atípicos (outliers) NO bajan la calidad.** Un valor "
|
||||
"extremo puede ser real y correcto; detectar atípicos es parte del "
|
||||
"análisis de la distribución, no un juicio de corrección. Por eso, junto "
|
||||
"con las columnas constantes y los identificadores, se listan aparte "
|
||||
"como **observaciones analíticas** que no afectan al score."
|
||||
)
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||||
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -72,16 +72,14 @@ def test_golden_chapter_estructura_y_version():
|
||||
assert "markdown" in kinds and "kv_table" in kinds and "data_table" in kinds
|
||||
|
||||
|
||||
def test_golden_intro_nombra_dos_dimensiones_y_pesos():
|
||||
# La intro nombra las dos dimensiones, sus pesos y la unicidad, pero ya NO
|
||||
# repite sus definiciones largas: estas viven ahora en el capítulo GLOSARIO.
|
||||
def test_golden_intro_explica_dos_dimensiones_y_pesos():
|
||||
ch = build_calidad(_profile(), {})
|
||||
intro = [b for b in ch.blocks if b.kind == "markdown"][0].text
|
||||
for needle in ("completitud", "validez", "60%", "40%",
|
||||
for needle in ("Completitud", "Validez", "60%", "40%",
|
||||
"unicidad de registro"):
|
||||
assert needle in intro, f"falta {needle!r} en la intro de criterios"
|
||||
# El principio: los outliers NO bajan la calidad.
|
||||
assert "atípicos" in intro and "no bajan" in intro
|
||||
assert "atípicos" in intro and "NO bajan" in intro
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||||
# Ya no se menciona la dimensión consistencia eliminada.
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||||
assert "20%" not in intro
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||||
|
||||
|
||||
@@ -356,11 +356,12 @@ def build_correlacion(profile: dict, ctx: dict):
|
||||
t_cramers = _term(mark_term, "cramers_v", "Cramér's V")
|
||||
t_corr_ratio = _term(mark_term, "correlation_ratio", "razón de correlación")
|
||||
blocks.append(model.Markdown(text=(
|
||||
"Asociación entre columnas. Cada par se evalúa con la métrica adecuada "
|
||||
f"a sus tipos: {t_pearson}/{t_spearman} (numéricas), {t_cramers} "
|
||||
f"(categóricas), {t_corr_ratio} (num-categórica) e información mutua. "
|
||||
"Sólo las correlaciones **num-num** llevan **signo** (dirección): por "
|
||||
"eso los pares **negativos** son siempre num-num.")))
|
||||
"Asociación entre columnas. Cada par se evalúa con la métrica adecuada a "
|
||||
f"sus tipos ({t_pearson}/{t_spearman} entre numéricas — con **signo**; "
|
||||
f"{t_cramers} entre categóricas; {t_corr_ratio} num-categórica; "
|
||||
"información mutua como medida común no lineal). Sólo las correlaciones "
|
||||
"**num-num** tienen dirección: por eso los pares **negativos** son siempre "
|
||||
"num-num.")))
|
||||
|
||||
# 1) Association matrix (heatmap).
|
||||
labels, trimmed = _ordered_labels(pairs)
|
||||
|
||||
@@ -6,16 +6,15 @@ normality}``). It renders, as structured markdown/tables/figures that the core
|
||||
paginator never cuts:
|
||||
|
||||
1. **Normalization note** — every multivariate model below standardizes the
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||||
columns with z-score first (the term is marked clickable; its definition
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||||
lives in the GLOSARIO chapter, not inline).
|
||||
columns with z-score first; the chapter explains why (different scales would
|
||||
otherwise dominate distance/variance).
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||||
2. **PCA** — a scree plot (explained + cumulative variance, single Y axis) plus
|
||||
variance and top-loadings tables.
|
||||
3. **KMeans segments** — a PCA scatter **coloured by cluster** (its own
|
||||
page/slide), the cluster-size table, and a per-cluster LLM micro-analysis
|
||||
with a title for each segment.
|
||||
4. **Isolation Forest outliers** — the multivariate anomaly counts and decision
|
||||
threshold (the method is marked clickable; its definition lives in the
|
||||
GLOSARIO chapter, not inline).
|
||||
4. **Isolation Forest outliers** — a short explanation of how anomalous rows are
|
||||
isolated multivariately and how the threshold is chosen, plus the counts.
|
||||
5. **Normality** — per-column Jarque-Bera / D'Agostino / Shapiro verdicts.
|
||||
|
||||
The raw numeric data needed to colour the cluster scatter is **not** in the
|
||||
@@ -315,8 +314,12 @@ def _normalization_intro(gloss=None, mark_term: bool = False) -> list:
|
||||
text = (
|
||||
"Estos modelos son **no supervisados**: buscan estructura latente sin "
|
||||
"una variable objetivo. Antes de aplicarlos, todas las columnas "
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||||
f"numéricas se {zscore}, para que todas pesen por igual con "
|
||||
"independencia de su escala."
|
||||
f"numéricas se {zscore} (cada valor menos la media, dividido por la "
|
||||
"desviación típica). Sin esta normalización, una variable con escala "
|
||||
"grande (p.ej. ingresos en euros) dominaría las distancias y la varianza "
|
||||
"frente a otra de escala pequeña (p.ej. un ratio entre 0 y 1), sesgando "
|
||||
"tanto el PCA como el KMeans. Tras la estandarización todas las variables "
|
||||
"pesan por igual."
|
||||
)
|
||||
return [model.Heading(text="Modelos no supervisados", level=1),
|
||||
model.Markdown(text=text)]
|
||||
@@ -331,11 +334,11 @@ def _pca_section(pca: dict, gloss=None, mark_term: bool = False) -> list:
|
||||
n_used = pca.get("n_rows_used")
|
||||
n_feat = pca.get("n_features")
|
||||
intro = (
|
||||
f"El {_term(mark_term, 'pca', 'PCA')} se aplica sobre "
|
||||
f"{_fmt_num(n_feat)} variables numéricas ({_fmt_num(n_used)} filas "
|
||||
"usadas tras eliminar nulos). El gráfico de sedimentación (scree) "
|
||||
"muestra cuánta varianza aporta cada componente y su acumulado: un "
|
||||
"codo marca cuántos componentes bastan."
|
||||
f"El {_term(mark_term, 'pca', 'PCA')} resume {_fmt_num(n_feat)} variables "
|
||||
"numéricas en componentes ortogonales ordenados por la varianza que "
|
||||
f"capturan ({_fmt_num(n_used)} filas usadas tras eliminar nulos). El "
|
||||
"gráfico de sedimentación (scree) muestra cuánta varianza aporta cada "
|
||||
"componente y su acumulado: un codo marca cuántos componentes bastan."
|
||||
)
|
||||
blocks.append(model.Markdown(text=intro))
|
||||
|
||||
@@ -400,8 +403,9 @@ def _kmeans_section(kmeans: dict, projection: dict, titles,
|
||||
t_sil = _term(mark_term, "silhouette", "*silhouette*")
|
||||
intro = (
|
||||
f"{t_kmeans} agrupa las filas en **{_fmt_num(best_k)} segmentos** "
|
||||
f"elegidos automáticamente por el coeficiente de {t_sil} "
|
||||
f"(**{_fmt_num(sil)}**). Los segmentos se proyectan sobre el plano de "
|
||||
f"elegidos automáticamente maximizando el coeficiente de {t_sil} "
|
||||
f"(**{_fmt_num(sil)}**, rango −1 a 1: cuanto más alto, segmentos más "
|
||||
"compactos y separados). Los segmentos se proyectan sobre el plano de "
|
||||
"los dos primeros componentes principales para visualizarlos."
|
||||
)
|
||||
blocks.append(model.Markdown(text=intro))
|
||||
@@ -465,10 +469,14 @@ def _outliers_section(outliers: dict, gloss=None, mark_term: bool = False) -> li
|
||||
level=2)]
|
||||
isof = _term(mark_term, "isolation_forest", "**Isolation Forest**")
|
||||
explain = (
|
||||
f"{isof} marca filas anómalas de forma *multivariante*: combinaciones "
|
||||
"de valores poco frecuentes considerando **todas las columnas a la "
|
||||
"vez**, no una sola. La tabla resume cuántas se detectaron y el umbral "
|
||||
"de decisión empleado."
|
||||
f"{isof} detecta filas anómalas de forma *multivariante*: "
|
||||
"construye árboles que parten el espacio con cortes aleatorios y mide "
|
||||
"cuántos cortes hacen falta para aislar cada fila. Las filas raras "
|
||||
"(combinaciones de valores poco frecuentes considerando **todas las "
|
||||
"columnas a la vez**, no una sola) se aíslan con muy pocos cortes y "
|
||||
"obtienen un score bajo. El **umbral** de decisión separa las filas "
|
||||
"normales de las anómalas según la contaminación esperada del modelo: "
|
||||
"una fila es outlier cuando su score queda por debajo de ese umbral."
|
||||
)
|
||||
blocks.append(model.Markdown(text=explain))
|
||||
blocks.append(model.KVTable(rows=[
|
||||
|
||||
@@ -256,14 +256,14 @@ def _pk_candidates_section(profile: dict, mark: bool) -> list:
|
||||
pk = ("[[term:pk]]**clave primaria**[[/term]]" if mark
|
||||
else "**clave primaria**")
|
||||
intro = (
|
||||
f"Columnas **candidatas a {pk}**: su "
|
||||
"[[term:cardinalidad]]cardinalidad[[/term]] iguala al número de filas y "
|
||||
"no tienen nulos. Son candidatas, no una clave declarada: la base no "
|
||||
"las marca como tal."
|
||||
f"Estas columnas son **candidatas a {pk}**: su "
|
||||
"[[term:cardinalidad]]cardinalidad[[/term]] iguala al número de filas y no "
|
||||
"tienen nulos, así que cada valor identifica una fila distinta. Son "
|
||||
"candidatas, no una clave declarada: la base no las marca como tal."
|
||||
if mark else
|
||||
"Columnas **candidatas a clave primaria**: su cardinalidad iguala al "
|
||||
"número de filas y no tienen nulos. Son candidatas, no una clave "
|
||||
"declarada.")
|
||||
"Estas columnas son **candidatas a clave primaria**: su cardinalidad "
|
||||
"iguala al número de filas y no tienen nulos, así que cada valor "
|
||||
"identifica una fila distinta.")
|
||||
|
||||
rows = []
|
||||
for name in keys:
|
||||
@@ -320,10 +320,10 @@ def _inter_table_section(db_path: str, tables: list, mark: bool) -> list:
|
||||
blocks = [
|
||||
model.Heading(text="Claves foráneas candidatas (inter-tabla)", level=2),
|
||||
model.Markdown(text=(
|
||||
f"La fuente tiene varias tablas. Estas {fk_term} candidatas se "
|
||||
f"infieren por señal de nombre y por {containment}. No están "
|
||||
"declaradas por la base; son la relación más probable según los "
|
||||
"datos.")),
|
||||
f"La fuente tiene varias tablas. Estas {fk_term} candidatas se infieren "
|
||||
f"por señal de nombre y por {containment}: una columna de una tabla cuyos "
|
||||
"valores están contenidos en la clave de otra. No están declaradas por "
|
||||
"la base; son la relación más probable según los datos.")),
|
||||
]
|
||||
|
||||
shown = candidates[:MAX_FK_ROWS]
|
||||
@@ -441,12 +441,13 @@ def _intro_blocks(mark: bool) -> list:
|
||||
pk = "[[term:pk]]clave primaria[[/term]]" if mark else "clave primaria"
|
||||
fk = "[[term:fk]]clave foránea[[/term]]" if mark else "clave foránea"
|
||||
text = (
|
||||
f"Este capítulo analiza las **relaciones de clave** de la tabla: cuál es "
|
||||
f"la {pk} y cuáles son las {fk}. Cuando la base las **declara** como "
|
||||
"restricciones del esquema, se muestran tal cual; cuando no, se proponen "
|
||||
"las más probables a partir de los datos —por containment entre tablas o, "
|
||||
"en una sola tabla, por una heurística de nombre y cardinalidad— siempre "
|
||||
"marcadas como candidatas, nunca como hechos.")
|
||||
f"Este capítulo analiza las **relaciones de clave** de la tabla: qué columna "
|
||||
f"identifica cada fila (la {pk}) y qué columnas referencian a otra tabla (las "
|
||||
f"{fk}). Cuando la base las **declara** como restricciones del esquema, se "
|
||||
"muestran tal cual; cuando no, se proponen las más probables a partir de los "
|
||||
"datos —por inclusión de valores entre tablas (containment) o, en una sola "
|
||||
"tabla, por una heurística de nombre y cardinalidad— siempre marcadas como "
|
||||
"candidatas, nunca como hechos.")
|
||||
return [model.Heading(text=CHAPTER_TITLE, level=1), model.Markdown(text=text)]
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -0,0 +1,458 @@
|
||||
"""AutomaticEDA Markdown serializer — one self-contained file to paste to an LLM.
|
||||
|
||||
Same document model as the PDF/PPTX renderers (an ordered list of
|
||||
:class:`Chapter`, each a list of format-independent blocks) but emitted as plain
|
||||
**Markdown** instead of a binary. The goal is different from the other two
|
||||
renderers: a Markdown EDA is meant to be *pasted into an LLM*, so it prioritises
|
||||
TEXT and DATA over visuals. Tables become Markdown tables (every row dumped, no
|
||||
pagination — nothing is cut because there are no pages); a ``Figure`` becomes its
|
||||
caption plus, when possible, the underlying bar/histogram data as a Markdown
|
||||
table (an LLM cannot see the image); glossary term markers are stripped while
|
||||
``**bold**`` is kept (it is valid Markdown).
|
||||
|
||||
dict-no-throw (the ``eda`` group style): :func:`render_md` never raises. On a
|
||||
fatal error it returns ``{path: None, ...}`` with a ``note`` explaining why; a
|
||||
malformed block degrades to a readable note rather than crashing the document.
|
||||
"""
|
||||
|
||||
from __future__ import annotations
|
||||
|
||||
import os
|
||||
import re
|
||||
|
||||
from . import model
|
||||
|
||||
# Glossary span markers (kept text, dropped markers). We intentionally do NOT use
|
||||
# ``text_layout.strip_inline_md`` for Markdown blocks because that also removes
|
||||
# ``**bold**`` — valid Markdown we want to preserve when pasting to an LLM.
|
||||
_TERM_OPEN_RE = re.compile(r"\[\[term:[A-Za-z0-9_]+\]\]")
|
||||
_MAX_BAR_ROWS = 100
|
||||
|
||||
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
# Small helpers.
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
def _clean_terms(s) -> str:
|
||||
"""Drop glossary term markers, keeping the visible text (and any **bold**)."""
|
||||
s = model._safe_str(s)
|
||||
s = _TERM_OPEN_RE.sub("", s)
|
||||
return s.replace("[[/term]]", "")
|
||||
|
||||
|
||||
def _cell(v) -> str:
|
||||
"""Render a value as a safe Markdown table cell.
|
||||
|
||||
Escapes pipes (``|`` -> ``\\|``) so they do not break the column layout and
|
||||
folds newlines to ``<br>`` so a multi-line value stays inside one cell. None
|
||||
becomes an empty string.
|
||||
"""
|
||||
s = model._safe_str(v)
|
||||
s = s.replace("|", "\\|")
|
||||
s = s.replace("\r\n", "\n").replace("\r", "\n").replace("\n", "<br>")
|
||||
return s
|
||||
|
||||
|
||||
def _slug(text: str) -> str:
|
||||
"""GitHub-style heading anchor: lowercase, spaces->'-', drop other symbols."""
|
||||
s = model._safe_str(text).strip().lower()
|
||||
out = []
|
||||
for ch in s:
|
||||
if ch.isalnum():
|
||||
out.append(ch)
|
||||
elif ch in " -":
|
||||
out.append("-")
|
||||
# any other symbol is dropped.
|
||||
slug = "".join(out)
|
||||
while "--" in slug:
|
||||
slug = slug.replace("--", "-")
|
||||
return slug.strip("-")
|
||||
|
||||
|
||||
def _fmt_num(v) -> str:
|
||||
"""Compact number for the figure data tables (ints as ints, else 4 sig figs)."""
|
||||
try:
|
||||
f = float(v)
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
return model._safe_str(v)
|
||||
if f != f: # NaN
|
||||
return "NaN"
|
||||
if f == int(f) and abs(f) < 1e15:
|
||||
return str(int(f))
|
||||
return f"{f:.4g}"
|
||||
|
||||
|
||||
def _fmt_int(v) -> str:
|
||||
try:
|
||||
return str(int(v))
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
return model._safe_str(v)
|
||||
|
||||
|
||||
def _now_iso() -> str:
|
||||
from datetime import datetime, timezone
|
||||
return datetime.now(timezone.utc).strftime("%Y-%m-%d %H:%M:%S UTC")
|
||||
|
||||
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
# Document header (title + metadata blockquote + numbered index).
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
def _meta_block(meta: dict) -> list:
|
||||
"""Build the metadata lines for the header blockquote (omitting absentees)."""
|
||||
ctx = meta.get("ctx") if isinstance(meta.get("ctx"), dict) else {}
|
||||
lines: list = []
|
||||
|
||||
def add(label, value) -> None:
|
||||
if value is None:
|
||||
return
|
||||
s = model._safe_str(value).strip()
|
||||
if s and s.lower() != "none":
|
||||
lines.append(f"**{label}:** {s}")
|
||||
|
||||
add("Dataset", ctx.get("dataset_name") or meta.get("dataset_name"))
|
||||
add("Fuente", ctx.get("source_origin") or meta.get("source_origin"))
|
||||
add("Almacenamiento", ctx.get("storage") or meta.get("storage"))
|
||||
n_rows = ctx.get("n_rows", meta.get("n_rows"))
|
||||
n_cols = ctx.get("n_cols", meta.get("n_cols"))
|
||||
if n_rows is not None and n_cols is not None:
|
||||
lines.append(
|
||||
f"**Dimensiones:** {_fmt_int(n_rows)} filas × {_fmt_int(n_cols)} columnas")
|
||||
add("Generado", meta.get("generated_at") or _now_iso())
|
||||
lines.append(f"**Motor:** {model.ENGINE_NAME} v{model.ENGINE_VERSION}")
|
||||
return lines
|
||||
|
||||
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
# Per-block serializers. Each returns a Markdown string (no surrounding blanks;
|
||||
# the caller separates blocks with a blank line).
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
def _md_heading(block) -> str:
|
||||
level = int(getattr(block, "level", 1) or 1)
|
||||
hashes = "#" * min(level + 2, 6) # level1 -> ###; '#'/'##' reserved for doc/chapter.
|
||||
text = _clean_terms(getattr(block, "text", "")).strip()
|
||||
return f"{hashes} {text}"
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_markdown(block) -> str:
|
||||
# Keep the text verbatim, dropping only glossary markers (keep **bold**).
|
||||
return _clean_terms(getattr(block, "text", "")).rstrip("\n")
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_kv_table(block) -> str:
|
||||
lines: list = []
|
||||
title = getattr(block, "title", None)
|
||||
if title:
|
||||
lines.append(f"**{_clean_terms(title).strip()}**")
|
||||
lines.append("")
|
||||
lines.append("| Campo | Valor |")
|
||||
lines.append("| --- | --- |")
|
||||
for row in (getattr(block, "rows", []) or []):
|
||||
try:
|
||||
label, value = row[0], row[1]
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
label, value = row, ""
|
||||
lines.append(f"| {_cell(label)} | {_cell(value)} |")
|
||||
return "\n".join(lines)
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_data_table(block) -> str:
|
||||
lines: list = []
|
||||
title = getattr(block, "title", None)
|
||||
if title:
|
||||
lines.append(f"**{_clean_terms(title).strip()}**")
|
||||
lines.append("")
|
||||
header = list(getattr(block, "header", []) or [])
|
||||
rows = list(getattr(block, "rows", []) or [])
|
||||
if not header:
|
||||
ncol = max((len(r) for r in rows), default=1)
|
||||
header = [f"col{i + 1}" for i in range(ncol)]
|
||||
ncol = len(header)
|
||||
lines.append("| " + " | ".join(_cell(h) for h in header) + " |")
|
||||
lines.append("| " + " | ".join(["---"] * ncol) + " |")
|
||||
for r in rows: # dump every row — no pagination, nothing cut.
|
||||
cells = [_cell(r[c]) if c < len(r) else "" for c in range(ncol)]
|
||||
lines.append("| " + " | ".join(cells) + " |")
|
||||
note = getattr(block, "note", None)
|
||||
if note:
|
||||
lines.append("")
|
||||
lines.append(f"*{_clean_terms(note).strip()}*")
|
||||
return "\n".join(lines)
|
||||
|
||||
|
||||
def _bars_table(bars: list) -> str:
|
||||
"""Render extracted bar/histogram data as a Markdown table (Desde/Hasta/Frec)."""
|
||||
lines = ["| Desde | Hasta | Frecuencia |", "| --- | --- | --- |"]
|
||||
shown = bars[:_MAX_BAR_ROWS]
|
||||
for x0, x1, h in shown:
|
||||
lines.append(f"| {_fmt_num(x0)} | {_fmt_num(x1)} | {_fmt_num(h)} |")
|
||||
out = "\n".join(lines)
|
||||
extra = len(bars) - len(shown)
|
||||
if extra > 0:
|
||||
out += f"\n\n*… ({extra} filas más)*"
|
||||
return out
|
||||
|
||||
|
||||
def _extract_bars(fig) -> list:
|
||||
"""Collect (x_from, x_to, height) of the rectangular bars of a matplotlib fig.
|
||||
|
||||
Histogram / bar-chart bars are ``matplotlib.patches.Rectangle`` with positive
|
||||
width and height; spines, legends and zero-area artists are skipped. Never
|
||||
raises — returns ``[]`` on any problem.
|
||||
"""
|
||||
bars: list = []
|
||||
try:
|
||||
for ax in fig.get_axes():
|
||||
# Collect this axes' positive-area rectangles, then keep only the ones
|
||||
# that look like actual histogram/bar bins. Reference shapes that
|
||||
# matplotlib also stores in ``ax.patches`` — most notably the ``±1σ``
|
||||
# band drawn by ``axvspan`` (a single rectangle far wider than a bin)
|
||||
# and a lone Tukey boxplot box — would otherwise show up as fake
|
||||
# "bins". A histogram axes has several near-equal-width bars, so we
|
||||
# drop any rectangle whose width is more than twice the median width
|
||||
# of that axes' rectangles (the σ-band spans many bins; uniform bins
|
||||
# all sit at the median width and stay).
|
||||
ax_bars: list = []
|
||||
for patch in list(getattr(ax, "patches", []) or []):
|
||||
try:
|
||||
w = patch.get_width()
|
||||
h = patch.get_height()
|
||||
x = patch.get_x()
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001 — not a Rectangle-like patch.
|
||||
continue
|
||||
if w and w > 0 and h and h > 0:
|
||||
ax_bars.append((x, x + w, h))
|
||||
if len(ax_bars) >= 3:
|
||||
widths = sorted(b[1] - b[0] for b in ax_bars)
|
||||
median_w = widths[len(widths) // 2]
|
||||
if median_w > 0:
|
||||
ax_bars = [b for b in ax_bars
|
||||
if (b[1] - b[0]) <= 2.0 * median_w]
|
||||
bars.extend(ax_bars)
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
return []
|
||||
return bars
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_figure(block, meta: dict, out_path: str, counter: list) -> str:
|
||||
"""Serialize a Figure prioritising TEXT + DATA (an LLM cannot see the image).
|
||||
|
||||
Emits the caption, then — if the matplotlib figure has bars — a Markdown table
|
||||
of the underlying (Desde, Hasta, Frecuencia) values. Optionally (when
|
||||
``meta['embed_figures']`` is True) also exports a PNG beside the .md and adds
|
||||
an image link; off by default so the Markdown stays self-contained.
|
||||
"""
|
||||
caption = model._safe_str(getattr(block, "caption", "")).strip()
|
||||
parts = [f"*Figura: {caption}*" if caption else "*Figura*"]
|
||||
fig = None
|
||||
try:
|
||||
import matplotlib
|
||||
matplotlib.use("Agg") # defensive: headless rasterization backend.
|
||||
fig = getattr(block, "fig", None)
|
||||
make = getattr(block, "make", None)
|
||||
if fig is None and callable(make):
|
||||
fig = make()
|
||||
if fig is not None:
|
||||
bars = _extract_bars(fig)
|
||||
if bars:
|
||||
parts.append(_bars_table(bars))
|
||||
if meta.get("embed_figures"):
|
||||
png = _embed_png(fig, out_path, counter)
|
||||
if png:
|
||||
parts.append(f"")
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001 — a bad figure degrades to just its caption.
|
||||
pass
|
||||
finally:
|
||||
if fig is not None:
|
||||
try:
|
||||
import matplotlib.pyplot as plt
|
||||
plt.close(fig)
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
pass
|
||||
return "\n\n".join(parts)
|
||||
|
||||
|
||||
def _embed_png(fig, out_path: str, counter: list) -> str:
|
||||
"""Export the figure to ``<basename>_figN.png`` beside the .md; return its name."""
|
||||
try:
|
||||
counter[0] += 1
|
||||
base = os.path.splitext(os.path.basename(out_path))[0] or "figura"
|
||||
name = f"{base}_fig{counter[0]}.png"
|
||||
path = os.path.join(os.path.dirname(os.path.abspath(out_path)), name)
|
||||
fig.savefig(path, format="png", dpi=120, bbox_inches="tight")
|
||||
return name
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
return ""
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_image(block) -> str:
|
||||
path = model._safe_str(getattr(block, "path", ""))
|
||||
caption = model._safe_str(getattr(block, "caption", "")).strip()
|
||||
out = f""
|
||||
if caption:
|
||||
out += f"\n\n*{caption}*"
|
||||
return out
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_caption(block) -> str:
|
||||
return f"*{_clean_terms(getattr(block, 'text', '')).strip()}*"
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_note(block) -> str:
|
||||
text = _clean_terms(getattr(block, "text", "")).strip()
|
||||
lines = text.split("\n")
|
||||
return "\n".join((f"> {ln}" if ln.strip() else ">") for ln in lines)
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_group(block, meta: dict, out_path: str, counter: list) -> str:
|
||||
parts: list = []
|
||||
title = getattr(block, "title", None)
|
||||
if title:
|
||||
parts.append(f"### {_clean_terms(title).strip()}")
|
||||
for b in (getattr(block, "blocks", []) or []):
|
||||
try:
|
||||
seg = _serialize_block(b, meta, out_path, counter)
|
||||
except Exception: # noqa: BLE001
|
||||
seg = ""
|
||||
if seg:
|
||||
parts.append(seg)
|
||||
return "\n\n".join(parts)
|
||||
|
||||
|
||||
def _md_glossary_entry(block) -> str:
|
||||
label = (model._safe_str(getattr(block, "label", "")).strip()
|
||||
or model._safe_str(getattr(block, "key", "")).strip())
|
||||
definition = _clean_terms(getattr(block, "definition", "")).strip()
|
||||
out = f"### {label}"
|
||||
if definition:
|
||||
out += f"\n\n{definition}"
|
||||
return out
|
||||
|
||||
|
||||
def _serialize_block(block, meta: dict, out_path: str, counter: list) -> str:
|
||||
"""Dispatch a single block to its Markdown serializer. Unknown -> note."""
|
||||
kind = getattr(block, "kind", "")
|
||||
if kind == "heading":
|
||||
return _md_heading(block)
|
||||
if kind == "markdown":
|
||||
return _md_markdown(block)
|
||||
if kind == "kv_table":
|
||||
return _md_kv_table(block)
|
||||
if kind == "data_table":
|
||||
return _md_data_table(block)
|
||||
if kind == "figure":
|
||||
return _md_figure(block, meta, out_path, counter)
|
||||
if kind == "image":
|
||||
return _md_image(block)
|
||||
if kind == "caption":
|
||||
return _md_caption(block)
|
||||
if kind == "note":
|
||||
return _md_note(block)
|
||||
if kind == "group":
|
||||
return _md_group(block, meta, out_path, counter)
|
||||
if kind == "glossary_entry":
|
||||
return _md_glossary_entry(block)
|
||||
# Unknown content -> readable note (mirrors the model's defensive coercion).
|
||||
return _md_note(model.Note(text=model._safe_str(block)))
|
||||
|
||||
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
# Entry point.
|
||||
# --------------------------------------------------------------------------- #
|
||||
def render_md(chapters: list, out_path: str, meta: dict = None) -> dict:
|
||||
"""Serialize a list of Chapters into a single self-contained Markdown file.
|
||||
|
||||
The output leads with ``# <title>``, a metadata blockquote and a numbered
|
||||
``## Índice`` linking each chapter, then one ``## N. <title>`` section per
|
||||
chapter with its blocks. Tables become Markdown tables (every row dumped),
|
||||
figures become caption + underlying data table, glossary markers are stripped
|
||||
while ``**bold**`` is kept. Designed to be pasted into an LLM.
|
||||
|
||||
Args:
|
||||
chapters: a list of ``Chapter`` (dataclasses or dicts); normalized
|
||||
defensively with ``model.as_chapters``.
|
||||
out_path: filesystem path for the ``.md`` (parent dirs are created).
|
||||
meta: optional dict. Recognised keys: ``title``, ``ctx`` (dict with
|
||||
``dataset_name``/``source_origin``/``storage``/``n_rows``/``n_cols``),
|
||||
``generated_at``, ``embed_figures`` (export PNGs beside the .md,
|
||||
default False).
|
||||
|
||||
Returns:
|
||||
dict (never raises): ``{path: str|None, n_chars: int,
|
||||
chapters: list[{id, version}], note: str}``. On a fatal error ``path`` is
|
||||
None and ``note`` explains why.
|
||||
"""
|
||||
meta = meta or {}
|
||||
chapters = model.as_chapters(chapters)
|
||||
title = model._safe_str(meta.get("title")) or model.ENGINE_NAME
|
||||
|
||||
# Edge: nothing to render -> a minimal but valid Markdown document.
|
||||
if not chapters:
|
||||
content = (f"# {title}\n\n"
|
||||
"*(documento vacío — sin capítulos aplicables)*\n")
|
||||
return _write(out_path, content, [], "documento vacío")
|
||||
|
||||
counter = [0] # document-wide figure counter for unique PNG names.
|
||||
notes: list = []
|
||||
segments: list = [f"# {title}"]
|
||||
|
||||
meta_lines = _meta_block(meta)
|
||||
if meta_lines:
|
||||
segments.append("\n".join(f"> {ln}" for ln in meta_lines))
|
||||
|
||||
# Numbered index. The anchor matches the chapter heading emitted below
|
||||
# (``## N. <title>``) in GitHub slug style.
|
||||
chap_heads = []
|
||||
idx_lines = ["## Índice"]
|
||||
for i, ch in enumerate(chapters, 1):
|
||||
head_text = f"{i}. {model._safe_str(ch.title)}"
|
||||
anchor = _slug(head_text)
|
||||
chap_heads.append((head_text, anchor))
|
||||
idx_lines.append(f"{i}. [{model._safe_str(ch.title)}](#{anchor})")
|
||||
segments.append("\n".join(idx_lines))
|
||||
|
||||
chapters_meta = []
|
||||
for i, ch in enumerate(chapters, 1):
|
||||
segments.append("---")
|
||||
head_text, _anchor = chap_heads[i - 1]
|
||||
segments.append(f"## {head_text}")
|
||||
|
||||
blocks = list(ch.blocks or [])
|
||||
# Omit a leading level-1 Heading that just repeats the chapter title.
|
||||
if blocks:
|
||||
b0 = blocks[0]
|
||||
if (getattr(b0, "kind", "") == "heading"
|
||||
and int(getattr(b0, "level", 1) or 1) == 1
|
||||
and _clean_terms(getattr(b0, "text", "")).strip()
|
||||
== model._safe_str(ch.title).strip()):
|
||||
blocks = blocks[1:]
|
||||
|
||||
for block in blocks:
|
||||
try:
|
||||
seg = _serialize_block(block, meta, out_path, counter)
|
||||
except Exception as e: # noqa: BLE001
|
||||
seg = _md_note(model.Note(text=model._safe_str(block)))
|
||||
notes.append(
|
||||
f"bloque '{getattr(block, 'kind', '?')}' del capítulo "
|
||||
f"'{ch.id}' degradado: {e}")
|
||||
if seg:
|
||||
segments.append(seg)
|
||||
chapters_meta.append({"id": ch.id, "version": ch.version})
|
||||
|
||||
content = "\n\n".join(segments) + "\n"
|
||||
note = f"{len(content)} caracteres"
|
||||
if notes:
|
||||
note += " · " + "; ".join(notes)
|
||||
return _write(out_path, content, chapters_meta, note)
|
||||
|
||||
|
||||
def _write(out_path: str, content: str, chapters_meta: list, note: str) -> dict:
|
||||
"""Write the Markdown to disk (creating parents). dict-no-throw."""
|
||||
try:
|
||||
parent = os.path.dirname(os.path.abspath(out_path))
|
||||
os.makedirs(parent, exist_ok=True)
|
||||
with open(out_path, "w", encoding="utf-8") as fh:
|
||||
fh.write(content)
|
||||
except Exception as e: # noqa: BLE001 — never raise from the writer.
|
||||
return {"path": None, "n_chars": 0, "chapters": [],
|
||||
"note": f"no se pudo escribir el Markdown: {e}"}
|
||||
return {"path": out_path, "n_chars": len(content),
|
||||
"chapters": chapters_meta, "note": note}
|
||||
@@ -0,0 +1,89 @@
|
||||
---
|
||||
name: render_automatic_eda_markdown
|
||||
kind: function
|
||||
lang: py
|
||||
domain: datascience
|
||||
version: "1.0.0"
|
||||
purity: impure
|
||||
signature: "def render_automatic_eda_markdown(chapters_or_profile, out_path: str, meta: dict = None) -> dict"
|
||||
description: "Renderiza un documento AutomaticEDA por CAPÍTULOS (modelo de bloques independiente del formato) en un único MARKDOWN autocontenido pensado para PEGAR A UN LLM. Acepta una lista de capítulos del modelo o directamente un TableProfile del grupo eda (construye los capítulos canónicos con build_document). Prioriza TEXTO + DATOS sobre lo visual: las tablas se vuelcan como tablas markdown con TODAS las filas (sin paginar — no hay páginas que cortar), una figura matplotlib se reduce a su caption más la tabla de datos subyacente (Desde/Hasta/Frecuencia de las barras del histograma) porque un LLM no ve la imagen, y los marcadores de glosario se eliminan conservando el **negrita**. Lleva cabecera (# título), bloque de metadatos en blockquote e índice numerado con anclas GitHub. Espejo de render_automatic_eda_pdf/render_automatic_eda_pptx pero SIN manifest (KISS, el markdown es un único artefacto de texto). dict-no-throw: nunca lanza, devuelve {path, n_chars, chapters, note}; en error fatal path es None y note explica la causa. Flag opcional meta['embed_figures'] exporta PNGs junto al .md (off por defecto)."
|
||||
tags: [eda, markdown, render, report, llm, automatic-eda, chapters, versioned, no-cut, text, datascience, python]
|
||||
uses_functions: []
|
||||
uses_types: []
|
||||
returns: []
|
||||
returns_optional: false
|
||||
error_type: "error_go_core"
|
||||
imports: [os, re, matplotlib, "datascience.automatic_eda"]
|
||||
params:
|
||||
- name: chapters_or_profile
|
||||
desc: "una lista de capítulos del modelo AutomaticEDA (dataclasses Chapter o dicts {id,title,version,blocks}) O un TableProfile dict del grupo eda. Si es un TableProfile, los capítulos canónicos se construyen con build_document(profile, meta['ctx']). Bloques soportados: heading, markdown, kv_table, data_table, figure, image, caption, note, group, glossary_entry. Lectura defensiva: lo no reconocido se degrada a Note, nunca lanza."
|
||||
- name: out_path
|
||||
desc: "ruta del archivo .md de salida. Los directorios padre se crean si faltan. Directorio no escribible → {path:None, note:<causa>} sin lanzar."
|
||||
- name: meta
|
||||
desc: "dict opcional. Claves: title (título del documento), ctx (dict con dataset_name→Dataset, source_origin→Fuente, storage→Almacenamiento, n_rows/n_cols→Dimensiones; también lo consumen los builders de capítulo cuando se da un profile), generated_at (timestamp; si falta se genera ISO UTC), embed_figures (True para exportar PNGs <basename>_figN.png junto al .md; por defecto False y el markdown queda autocontenido)."
|
||||
output: "dict (nunca lanza): {path: str|None, n_chars: int, chapters: list[{id,version}], note: str}. En error fatal (p.ej. directorio no escribible) path es None y note explica la causa. Un documento sin capítulos aplicables produce un markdown mínimo válido con 'documento vacío' y chapters=[]."
|
||||
tested: true
|
||||
tests: ["test_golden_bloques_sinteticos_serializa_todo_a_markdown", "test_edge_documento_vacio_no_revienta", "test_profile_path_construye_capitulos_y_escribe"]
|
||||
test_file_path: "python/functions/datascience/render_automatic_eda_markdown_test.py"
|
||||
file_path: "python/functions/datascience/render_automatic_eda_markdown.py"
|
||||
---
|
||||
|
||||
## Ejemplo
|
||||
|
||||
```python
|
||||
from datascience import render_automatic_eda_markdown
|
||||
|
||||
# Desde un TableProfile del grupo eda (mismo modelo que los renderers PDF/PPTX).
|
||||
profile = {
|
||||
"table": "ventas", "source": "/data/ventas.csv",
|
||||
"n_rows": 1000, "n_cols": 2, "quality_score": 92.5,
|
||||
"columns": [
|
||||
{"name": "precio", "inferred_type": "numeric", "null_pct": 0.01,
|
||||
"numeric": {"mean": 42.5, "median": 40.0, "min": 1.0, "max": 100.0,
|
||||
"std": 12.3}},
|
||||
{"name": "categoria", "inferred_type": "categorical", "null_pct": 0.0,
|
||||
"categorical": {"top": [{"value": "neumaticos", "count": 500}]}},
|
||||
],
|
||||
}
|
||||
res = render_automatic_eda_markdown(
|
||||
profile, "reports/ventas_aeda.md",
|
||||
{"title": "EDA — ventas",
|
||||
"ctx": {"dataset_name": "Ventas", "source_origin": "ERP export",
|
||||
"n_rows": 1000, "n_cols": 2}})
|
||||
print(res["path"], res["n_chars"], res["chapters"])
|
||||
# -> reports/ventas_aeda.md 4123 [{'id':'portada','version':'1.0.0'}, ...]
|
||||
```
|
||||
|
||||
## Cuando usarla
|
||||
|
||||
Cuando quieras **pegar el EDA a un LLM** (ChatGPT, Claude, ...) o tenerlo en texto
|
||||
plano versionable: mismo documento por capítulos que el PDF/PPTX, pero serializado a
|
||||
Markdown sin binarios. Úsala como tercera salida junto a `render_automatic_eda_pdf`
|
||||
(móvil) y `render_automatic_eda_pptx` (compartir) desde el MISMO modelo de capítulos.
|
||||
A diferencia de esas dos, no hay páginas ni slides: todas las filas de cada tabla se
|
||||
vuelcan (nada se corta) y cada figura se reduce a su caption + la tabla de datos
|
||||
subyacente, que es lo que un LLM puede leer. Para añadir capítulos al documento, ver
|
||||
`docs/capabilities/automatic_eda.md`.
|
||||
|
||||
## Gotchas
|
||||
|
||||
- **Impura**: escribe el `.md` en `out_path` (crea los directorios padre). Con
|
||||
`meta['embed_figures']=True` además exporta un PNG `<basename>_figN.png` por figura
|
||||
junto al `.md`; por defecto NO exporta nada y el markdown queda autocontenido.
|
||||
- **Nunca lanza** (dict-no-throw): un bloque que falle se degrada a una nota y se anota
|
||||
en `note`; el documento se escribe igual. Un profile/lista vacíos producen un markdown
|
||||
mínimo válido con `*(documento vacío …)*` y `chapters=[]`.
|
||||
- **Figuras = datos, no imagen**: un bloque `figure` se serializa como `*Figura: caption*`
|
||||
más, si la figura matplotlib trae barras (histograma / barras), una tabla
|
||||
`| Desde | Hasta | Frecuencia |` extraída de los `Rectangle` patches (máx 100 filas;
|
||||
el resto se trunca con `*… (N filas más)*`). Si no hay barras o algo falla, solo sale
|
||||
el caption. La figura se cierra (`plt.close`) tras leerla.
|
||||
- **Glosario vs negrita**: se eliminan SOLO los marcadores de glosario
|
||||
`[[term:key]]visible[[/term]]` (queda `visible`); el `**negrita**` markdown SE
|
||||
CONSERVA (es válido). No se usa `strip_inline_md` aquí porque ese también quita el bold.
|
||||
- **Anclas del índice**: el `## Índice` enlaza cada capítulo con un ancla estilo GitHub
|
||||
del encabezado `## N. Título` (minúsculas, espacios→`-`, sin signos). Si dos capítulos
|
||||
comparten título exacto sus anclas colisionan (caso raro; los capítulos canónicos tienen
|
||||
títulos únicos).
|
||||
- **Tablas**: las celdas escapan `|` (→ `\|`) y pliegan saltos de línea a `<br>` para no
|
||||
romper la columna. No hay reparto por ancho — un LLM no lo necesita.
|
||||
@@ -0,0 +1,55 @@
|
||||
"""render_automatic_eda_markdown — chapter-based EDA report as one Markdown file.
|
||||
|
||||
Public ``eda``-group entry point that serializes an AutomaticEDA document (a list
|
||||
of chapters, or an ``eda`` TableProfile from which the canonical chapters are
|
||||
built) into a single self-contained Markdown file optimised to be **pasted into
|
||||
an LLM**: plain text, Markdown tables (every row dumped — there are no pages to
|
||||
cut), figures reduced to caption + underlying data, no binaries. It mirrors
|
||||
``render_automatic_eda_pdf`` / ``render_automatic_eda_pptx`` but for text output;
|
||||
unlike those it writes no manifest (KISS — Markdown is a single text artefact).
|
||||
|
||||
dict-no-throw: never raises. Returns ``{path, n_chars, chapters, note}``; on a
|
||||
fatal error ``path`` is None and ``note`` explains why.
|
||||
"""
|
||||
|
||||
from __future__ import annotations
|
||||
|
||||
from datascience.automatic_eda import build_document, render_md
|
||||
from datascience.automatic_eda.model import as_chapter, as_chapters
|
||||
|
||||
|
||||
def _coerce_chapters(chapters_or_profile, meta: dict) -> list:
|
||||
"""Accept chapters OR an eda profile and return a list of Chapter."""
|
||||
arg = chapters_or_profile
|
||||
if isinstance(arg, (list, tuple)):
|
||||
return as_chapters(list(arg))
|
||||
if isinstance(arg, dict):
|
||||
if "blocks" in arg and "columns" not in arg:
|
||||
ch = as_chapter(arg)
|
||||
return [ch] if ch is not None else []
|
||||
return build_document(arg, (meta or {}).get("ctx"))
|
||||
return []
|
||||
|
||||
|
||||
def render_automatic_eda_markdown(chapters_or_profile, out_path: str,
|
||||
meta: dict = None) -> dict:
|
||||
"""Render an AutomaticEDA document into a single self-contained Markdown file.
|
||||
|
||||
Args:
|
||||
chapters_or_profile: a list of chapters (``Chapter`` dataclasses or
|
||||
dicts) or an ``eda`` TableProfile dict (chapters built via
|
||||
``build_document(profile, meta['ctx'])``).
|
||||
out_path: filesystem path for the ``.md`` (parent dirs are created).
|
||||
meta: optional dict. Recognised keys: ``title``, ``ctx`` (dict with
|
||||
``dataset_name``/``source_origin``/``storage``/``n_rows``/``n_cols``),
|
||||
``generated_at``, ``embed_figures`` (export PNGs beside the .md,
|
||||
default False — off keeps the Markdown self-contained).
|
||||
|
||||
Returns:
|
||||
dict (never raises): ``{path: str|None, n_chars: int,
|
||||
chapters: list[{id, version}], note: str}``. On a fatal error ``path`` is
|
||||
None and ``note`` explains the cause.
|
||||
"""
|
||||
meta = dict(meta or {})
|
||||
chapters = _coerce_chapters(chapters_or_profile, meta)
|
||||
return render_md(chapters, out_path, meta)
|
||||
@@ -0,0 +1,168 @@
|
||||
"""Tests for render_automatic_eda_markdown — DoD: golden + edge + profile path.
|
||||
|
||||
Self-contained synthetic blocks (no DuckDB). Verifies every block kind serializes
|
||||
to Markdown (heading, markdown with glossary+bold, kv/data tables, a figure whose
|
||||
histogram bars become a data table, caption, note, group, glossary entry), that a
|
||||
leading level-1 heading equal to the chapter title is omitted, that an empty
|
||||
document degrades to a valid minimal Markdown without raising, and that passing a
|
||||
minimal TableProfile builds chapters and writes the file.
|
||||
"""
|
||||
|
||||
import os
|
||||
import tempfile
|
||||
|
||||
from datascience.render_automatic_eda_markdown import render_automatic_eda_markdown
|
||||
from datascience.automatic_eda.model import (
|
||||
Caption, Chapter, DataTable, Figure, GlossaryEntry, Group, Heading, KVTable,
|
||||
Markdown, Note,
|
||||
)
|
||||
|
||||
|
||||
def _hist_fig():
|
||||
import matplotlib
|
||||
matplotlib.use("Agg")
|
||||
import matplotlib.pyplot as plt
|
||||
fig, ax = plt.subplots()
|
||||
ax.hist([1, 1, 2, 2, 2, 3, 4, 4, 5, 5, 5, 5], bins=5)
|
||||
return fig
|
||||
|
||||
|
||||
def _chapters() -> list:
|
||||
blocks = [
|
||||
Heading("Demo", 1), # == chapter title -> omitted.
|
||||
Heading("Seccion dos", 2), # -> ####
|
||||
Markdown("Texto con [[term:ent]]entropia[[/term]] y **bold** aqui."),
|
||||
KVTable(rows=[("Filas", 1000), ("Columnas", 5)], title="Resumen"),
|
||||
DataTable(header=["col", "valor"],
|
||||
rows=[["alpha", "111"], ["beta", "222"], ["gamma", "333"]],
|
||||
title="Datos", note="nota inferior"),
|
||||
Figure(make=_hist_fig, caption="Histograma demo"),
|
||||
Caption("pie de figura"),
|
||||
Note("una nota aparte"),
|
||||
Group(title="Grupo X", blocks=[Markdown("dentro del grupo")]),
|
||||
GlossaryEntry(key="ent", label="Entropia",
|
||||
definition="Medida de incertidumbre."),
|
||||
]
|
||||
return [Chapter(id="demo", title="Demo", version="1.0.0", blocks=blocks)]
|
||||
|
||||
|
||||
def _read(path: str) -> str:
|
||||
with open(path, "r", encoding="utf-8") as fh:
|
||||
return fh.read()
|
||||
|
||||
|
||||
def test_golden_bloques_sinteticos_serializa_todo_a_markdown():
|
||||
with tempfile.TemporaryDirectory() as d:
|
||||
out = os.path.join(d, "demo.md")
|
||||
res = render_automatic_eda_markdown(
|
||||
_chapters(), out,
|
||||
{"title": "EDA Demo",
|
||||
"ctx": {"dataset_name": "Demo", "n_rows": 12, "n_cols": 2}})
|
||||
assert res["path"] == out
|
||||
assert os.path.exists(out)
|
||||
assert res["n_chars"] > 0
|
||||
assert res["chapters"] == [{"id": "demo", "version": "1.0.0"}]
|
||||
|
||||
content = _read(out)
|
||||
# Document structure.
|
||||
assert content.startswith("# ")
|
||||
assert "## Índice" in content
|
||||
# A Markdown table is present (header + separator row).
|
||||
assert "| " in content and "| --- " in content
|
||||
# DataTable values are all dumped.
|
||||
for v in ("alpha", "111", "beta", "222", "gamma", "333"):
|
||||
assert v in content
|
||||
# Glossary markers stripped, bold kept.
|
||||
assert "[[term" not in content
|
||||
assert "[[/term]]" not in content
|
||||
assert "**bold**" in content
|
||||
assert "entropia" in content # visible glossary text preserved.
|
||||
# Figure histogram bars became a data table.
|
||||
assert "| Desde | Hasta | Frecuencia |" in content
|
||||
# Glossary entry rendered as a level-3 heading.
|
||||
assert "### Entropia" in content
|
||||
# Level-2 heading -> ####.
|
||||
assert "#### Seccion dos" in content
|
||||
# Leading level-1 heading equal to the title was omitted.
|
||||
assert "### Demo" not in content
|
||||
# Group title rendered.
|
||||
assert "### Grupo X" in content
|
||||
|
||||
|
||||
def _hist_fig_with_span():
|
||||
"""Histogram with a wide ``axvspan`` (±1σ band) over it.
|
||||
|
||||
Reproduces the num_distr figure shape: matplotlib keeps the span as a lone
|
||||
Rectangle in ``ax.patches`` alongside the bin bars; it must NOT leak into the
|
||||
extracted bins table as a fake bin (it is ~5x wider than a bin)."""
|
||||
import matplotlib
|
||||
matplotlib.use("Agg")
|
||||
import matplotlib.pyplot as plt
|
||||
fig, ax = plt.subplots()
|
||||
data = [1, 1, 2, 2, 2, 3, 4, 4, 5, 5, 5, 5]
|
||||
ax.hist(data, bins=5)
|
||||
ax.axvspan(2.0, 4.0, alpha=0.2) # mean±σ band — a wide stray rectangle.
|
||||
return fig
|
||||
|
||||
|
||||
def test_figura_descarta_axvspan_de_la_tabla_de_bins():
|
||||
"""The ±1σ band rectangle must not appear as a row in the bins table."""
|
||||
blocks = [Figure(make=_hist_fig_with_span, caption="Hist con banda")]
|
||||
chapters = [Chapter(id="f", title="Fig", version="1.0.0", blocks=blocks)]
|
||||
with tempfile.TemporaryDirectory() as d:
|
||||
out = os.path.join(d, "fig.md")
|
||||
render_automatic_eda_markdown(chapters, out, {"title": "T"})
|
||||
content = _read(out)
|
||||
assert "| Desde | Hasta | Frecuencia |" in content
|
||||
# Extract the rows of the bins table: lines between the header/separator
|
||||
# and the next blank line.
|
||||
lines = content.splitlines()
|
||||
hi = next(i for i, ln in enumerate(lines)
|
||||
if ln.startswith("| Desde | Hasta | Frecuencia |"))
|
||||
rows = []
|
||||
for ln in lines[hi + 2:]: # skip header + separator
|
||||
if not ln.startswith("|"):
|
||||
break
|
||||
rows.append(ln)
|
||||
# 5 histogram bins, no extra wide span row.
|
||||
assert len(rows) == 5, rows
|
||||
# No row spans a width of ~2.0 (the axvspan from x=2 to x=4).
|
||||
for ln in rows:
|
||||
cells = [c.strip() for c in ln.strip("|").split("|")]
|
||||
lo, hi_v = float(cells[0]), float(cells[1])
|
||||
assert (hi_v - lo) < 1.5, f"wide span leaked: {ln}"
|
||||
|
||||
|
||||
def test_edge_documento_vacio_no_revienta():
|
||||
with tempfile.TemporaryDirectory() as d:
|
||||
out = os.path.join(d, "empty.md")
|
||||
res = render_automatic_eda_markdown([], out, {})
|
||||
assert res["path"] == out
|
||||
assert os.path.exists(out)
|
||||
assert res["chapters"] == []
|
||||
content = _read(out)
|
||||
assert "documento vacío" in content
|
||||
assert content.startswith("# ")
|
||||
|
||||
|
||||
def test_profile_path_construye_capitulos_y_escribe():
|
||||
profile = {
|
||||
"table": "mini",
|
||||
"source": "/data/mini.csv",
|
||||
"n_rows": 10,
|
||||
"n_cols": 1,
|
||||
"quality_score": 88.0,
|
||||
"columns": [
|
||||
{"name": "x", "inferred_type": "numeric", "null_pct": 0.0,
|
||||
"null_count": 0,
|
||||
"numeric": {"mean": 1.0, "median": 1.0, "min": 0.0, "max": 2.0,
|
||||
"std": 0.5}},
|
||||
],
|
||||
}
|
||||
with tempfile.TemporaryDirectory() as d:
|
||||
out = os.path.join(d, "mini.md")
|
||||
res = render_automatic_eda_markdown(
|
||||
profile, out, {"title": "Mini", "ctx": {"dataset_name": "Mini"}})
|
||||
assert res["path"] == out # not None — no exception, file written.
|
||||
assert os.path.exists(out)
|
||||
assert res["n_chars"] > 0
|
||||
@@ -1,9 +1,10 @@
|
||||
"""render_automatic_eda — EDA completo one-shot: perfil → ctx → PDF + PPTX.
|
||||
"""render_automatic_eda — EDA completo one-shot: perfil → ctx → PDF + PPTX + MD.
|
||||
|
||||
Pipeline impuro del grupo de capacidad `eda`. Dada UNA tabla DuckDB (o
|
||||
PostgreSQL), produce el informe AutomaticEDA COMPLETO en sus dos formatos a la
|
||||
vez (PDF móvil A5 + PPTX 16:9) con los 11 capítulos POBLADOS, en una sola
|
||||
llamada. Compone, sin reimplementar su lógica, cuatro funciones del registry:
|
||||
PostgreSQL), produce el informe AutomaticEDA COMPLETO en sus tres formatos a la
|
||||
vez (PDF móvil A5 + PPTX 16:9 + Markdown autocontenido para pegar a un LLM) con
|
||||
los capítulos POBLADOS, en una sola llamada. Compone, sin reimplementar su
|
||||
lógica, varias funciones del registry:
|
||||
|
||||
- profile_table : perfila la tabla end-to-end (TableProfile agregado),
|
||||
opcionalmente con modelos baratos y análisis de serie.
|
||||
@@ -12,8 +13,11 @@ llamada. Compone, sin reimplementar su lógica, cuatro funciones del registry:
|
||||
modelos/geo, timeseries_raw para series, geo_points
|
||||
para el mapa, db_path/table para la agregación
|
||||
push-down). Sin él, esos capítulos degradan.
|
||||
- render_automatic_eda_pdf : renderiza el documento por capítulos a PDF.
|
||||
- render_automatic_eda_pptx : renderiza el mismo documento a PPTX.
|
||||
- render_automatic_eda_pdf : renderiza el documento por capítulos a PDF.
|
||||
- render_automatic_eda_pptx : renderiza el mismo documento a PPTX.
|
||||
- render_automatic_eda_markdown : serializa el mismo documento a Markdown
|
||||
autocontenido (texto + tablas markdown, sin
|
||||
binarios) para incorporar a un LLM.
|
||||
|
||||
El TableProfile agregado basta para portada/overview/distribuciones/calidad/
|
||||
correlación, pero los capítulos `modelos`, `timeseries`, `geospatial` y
|
||||
@@ -32,6 +36,7 @@ from datetime import datetime, timezone
|
||||
|
||||
from datascience import (
|
||||
build_eda_render_ctx,
|
||||
render_automatic_eda_markdown,
|
||||
render_automatic_eda_pdf,
|
||||
render_automatic_eda_pptx,
|
||||
run_eda_models,
|
||||
@@ -93,6 +98,7 @@ def render_automatic_eda(
|
||||
out_dir: str = "reports",
|
||||
basename: str = None,
|
||||
ctx_extra: dict = None,
|
||||
emit_md: bool = True,
|
||||
) -> dict:
|
||||
"""Perfila una tabla y emite el informe AutomaticEDA completo (PDF + PPTX).
|
||||
|
||||
@@ -140,13 +146,19 @@ def render_automatic_eda(
|
||||
ctx_extra: dict opcional con claves de presentación/contexto extra que se
|
||||
mezclan en el ctx (p.ej. dataset_name, description, source_origin).
|
||||
No pisan las claves de datos calculadas por build_eda_render_ctx.
|
||||
emit_md: además del PDF y el PPTX, emite un Markdown autocontenido del
|
||||
MISMO documento por capítulos (texto plano + tablas markdown, sin
|
||||
binarios), pensado para pegar a un LLM. Default True. La ruta sale en
|
||||
la clave de retorno ``aeda_md_path``. No altera las demás salidas.
|
||||
|
||||
Returns:
|
||||
dict (nunca lanza). En éxito::
|
||||
|
||||
{"status": "ok", "pdf_path": str, "pptx_path": str,
|
||||
"manifest_path": str|None, "n_pages": int, "n_slides": int,
|
||||
"pdf_note": str, "pptx_note": str, "profile": <TableProfile>}
|
||||
"aeda_md_path": str|None, "manifest_path": str|None,
|
||||
"n_pages": int, "n_slides": int, "md_chars": int|None,
|
||||
"pdf_note": str, "pptx_note": str, "md_note": str|None,
|
||||
"profile": <TableProfile>}
|
||||
|
||||
En error: {"status": "error", "error": str}.
|
||||
"""
|
||||
@@ -243,15 +255,26 @@ def render_automatic_eda(
|
||||
rpdf = render_automatic_eda_pdf(prof, pdf_path, meta) or {}
|
||||
rpptx = render_automatic_eda_pptx(prof, pptx_path, meta) or {}
|
||||
|
||||
# Salida Markdown autocontenida (mismo documento por capítulos) para
|
||||
# pegar a un LLM. Aditiva: no afecta a PDF/PPTX/manifest. dict-no-throw.
|
||||
rmd = {}
|
||||
md_path = None
|
||||
if emit_md:
|
||||
md_path = os.path.join(out_dir, base + ".md")
|
||||
rmd = render_automatic_eda_markdown(prof, md_path, meta) or {}
|
||||
|
||||
return {
|
||||
"status": "ok",
|
||||
"pdf_path": rpdf.get("path"),
|
||||
"pptx_path": rpptx.get("path"),
|
||||
"aeda_md_path": rmd.get("path"),
|
||||
"manifest_path": rpdf.get("manifest_path"),
|
||||
"n_pages": rpdf.get("n_pages"),
|
||||
"n_slides": rpptx.get("n_slides"),
|
||||
"md_chars": rmd.get("n_chars"),
|
||||
"pdf_note": rpdf.get("note"),
|
||||
"pptx_note": rpptx.get("note"),
|
||||
"md_note": rmd.get("note"),
|
||||
"profile": prof,
|
||||
}
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except Exception as e: # noqa: BLE001 — dict-no-throw: degradar, nunca lanzar.
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