egutierrez 4f1530797e feat(datascience): rigor experimental para papers — effect size, IC, Holm + preregistro inmutable
Subsistema de papers reproducibles (grupo de capacidad `papers`). Añade las
funciones estadísticas que un paper honesto necesita y la función que congela la
hipótesis antes de mirar los datos (anti-HARKing).

Nuevas funciones (puras salvo la última):
- effect_size_cohens_d: Cohen's d + Hedges' g (corrección de sesgo para N
  pequeño) + interpretación cualitativa (negligible/small/medium/large por los
  umbrales de Cohen). Dict-no-throw ante varianza cero / N insuficiente.
- confidence_interval_mean: intervalo de confianza de una media (t de Student) o
  de la diferencia de medias con Welch (df de Welch–Satterthwaite, sin asumir
  varianzas iguales). Dict-no-throw; el IC colapsa al punto cuando la varianza es
  cero.
- preregister_hypothesis (impura): congela hipótesis + plan de análisis en
  papers/<slug>/preregistration.md con frozen_at (UTC) y content_hash (sha256 del
  cuerpo normalizado, no del frontmatter). Inmutabilidad: una vez frozen, un
  contenido distinto se RECHAZA sin sobrescribir (mata el HARKing); idempotente si
  el contenido es idéntico. Siempre dict-no-throw.

Extensión:
- fdr_correction 1.0.0 -> 1.1.0: añade method="holm" (Holm-Bonferroni step-down,
  controla FWER, más potente que Bonferroni simple). Reúsa la maquinaria de
  alineación 1:1 con None/inválidos; no rompe los métodos bh/bonferroni.

Reutiliza del registry: fdr_correction (BH + Bonferroni ya existían) como base
para Holm. pearson y spearman_corr ya cubrían correlación.

Tests: 36 pytest verdes (cohen/hedges 8, confidence/welch 8, fdr/holm/bonferroni
12, preregister 4 + extras), golden contra valores conocidos y validados con
scipy. Golden manual del preregistro: congela, idempotente, rechaza edición
(bytes en disco idénticos al congelado).

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-06-30 20:42:12 +02:00
2026-06-29 11:05:00 +02:00
2026-05-30 17:28:47 +02:00
2026-05-30 17:28:47 +02:00
2026-05-30 17:28:47 +02:00
2026-06-27 20:43:03 +02:00

fn-registry — Schema de documentación

Registry personal de código con búsqueda FTS. Diseñado para composición funcional y agentes.

Archivos

  • functions.md — Schema de la tabla functions (incluye pipelines y componentes React)
  • types.md — Schema de la tabla types
  • integrity.md — Reglas de integridad y referencias cruzadas
  • architecture.md — Visión general del sistema
  • sync_setup.md — Vincular una PC al server registry.organic-machine.com (env vars, fn sync, troubleshooting)
  • adr/ — Architecture Decision Records: decisiones de diseño (qué se decidió y por qué)
  • ../reports/ — Reportes de trabajo: artefacto local (entregable de una tarea: qué se hizo, cómo se verificó, gaps). Gitignored salvo .gitkeep, NO sube a Gitea ni se versiona (como los vaults). Convención en .claude/rules/reports.md. Decisión: ADR 0006

Tablas

Tabla Descripción
functions Funciones atómicas, pipelines y componentes React
types Tipos algebraicos (product / sum)

kind: valores posibles

Valor Descripción
function Función atómica pura o impura
pipeline Composición de funciones, siempre impura
component Componente React, extiende el schema base

fn-registry schema v1.0

S
Description
Registry personal de codigo reutilizable con busqueda FTS
Readme 188 MiB
Languages
Python 51.7%
Go 18.5%
C++ 15%
Shell 8.1%
C 3.4%
Other 3.2%